A Flor de lis do Colégio São José é um símbolo muito reconhecido pelos nossos alunos, ex-alunos e toda a comunidade escolar. Elaborada pela nossa querida Ir. Anunciada em 1977, possui um significado ímpar, as três pétalas representam a fé, a sabedoria e o valor, a união das pétalas é feita pelo laço fraternal e o conjunto do desenho revela o dever para com Deus que o nosso Colégio possui.

Com o passar das décadas a nossa flor, assim como a própria instituição de ensino, foi se modernizando e se adequando ao tempo. Hoje, em 2023, temos um desenho com linhas mais finas, mais detalhes, trazendo ainda mais delicadeza e elegância. O uso dos tons de azuis é uma tradição, inspirada pela psicologia da cor azul, representado a fé, espiritualidade, confiança, unidade, verdade e paz, valores que o Colégio São José preza. As fontes utilizadas, além de levar em consideração a legibilidade, foram escolhidas afim de representar a tradição e modernidade, com serifas sutis que lembram fontes antigas, mas com design reformulado e atual.